Dieval Guizelini

Os passos básicos são: descomentar o repositório canonical em /etc/apt/source.list deb http://archive.canonical.com/ubuntu natty partner deb-src http://archive.canonical.com/ubuntu natty partner Atualizar: apt-get update pode-se busca com apt-cache search sun-java6 ou apt-get install sun-java6-jdk sun-java6-bin sun-java6-source sun-java6-fonts sun-java6-jre Para alternar entre as versões instaladas (Open/SUN): update-alternatives --config java

Quem já se deparou com esse problema deve saber a dificuldade em encontrar um programa que faça essa conversão. Bom, depois de testar um monte de coisas, andei estudando os fontes do "Color Space Mapping tool" da AB (http://www.appliedbiosystems.com/absite/us/en/home/support/software-community/free-ab-software.html) e descobri uma regra de conversão simples: A0=>'A' A1=>'C' A2=>'G' A3=>'T' C0=>'C' C1=>'A' C2=>'T' C3=>'G' G0=>'G' G1=>'T' G2=>'A' G3=>'C' T0=>'T' T1=>'G' T2=>'C' T3=>'A' Com essa informação, fiz o programa abaixo (GNU C): #include #include #include #define MAX_LINE 500 int main(int argc, char *argv[]) { FILE *fin,*fout; char buffer[MAX_LINE+1],seq[MAX_LINE]; char p0,p1,base,valid; int i; if( argc \n"); exit(0); } if( (fin = fopen(argv[1],"r")) == N...

Demorou, mas agora pude fazer o upgrade (não dava para fazer antes de concluir o mestrado). Primeiros passos: a) copiar tudo que importa para o HD externo e para algumas coisas para a partição do Windows 7. b) baixar e gravar mídia de instalação c) testar no modo live-cd (uma das boas coisas do Ubuntu) - Beleza, placa de vídeo, som, webcam, rede tudo certo. d) instalado e atualizado Primeiras impressões: o boot está mais rápido, o visual do desktop mais limpo (aparentemente, existe um aproveitamento melhor da área real disponível). Instalando os pacotes de trabalho: sudo -s apt-get install build-essential apt-get install openssh-server apt-get install mysql-server-5.1 mysql-common mysql-client-5.1 mysql-client-core-5.1 mysql-client-5.1 mysql-server-core-5.1 apt-get install apache2-mpm-prefork apache2-utils apache2.2-bin apache2.2-common libapache2-mod-php5 php5-cli php5-common apt-get install postgresql-8.4 postgresql-client-8.4 postgresql-contribu-8.4 php5-pgsq...

O pacote glossaries (do mesmo criador do pacote glossary) oferece um bom recurso para quem precisa escrever texto e utilizar glossários e listas de siglas/símbolos. E frequentemente temos que trabalhar com siglas e glossários para a mesma coisa, por exemplo: Associação Brasileira de Normas Técnicas (ABNT) é o órgão responsável pela normalização técnica no país, fornecendo a base necessária ao desenvolvimento tecnológico brasileiro. Nesse caso, na primeira ocorrência utilizamos /gls{ABNT} e o glossaries irá apresentar dessa forma na primeira ocorrência "Associação Brasileira de Normas Técnicas (ABNT)", nas vezes posteriores, apenas ABNT. E no glossário: ABNT Associação Brasileira de Normas Técnicas é o órgão responsável pela normalização técnica no país, fornecendo a base necessária ao desenvolvimento tecnológico brasileiro. É mole o quer mais? http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/contrib/glossaries/ No Windows, utilizando o Lyx, precisei fazer: - Ger...

Os recursos do glossário são interessantes, porém os passos para funcionar adequadamente... ainda deixam a desejar. Primeiramente baixe os pacotes no ctan: http://tug.ctan.org/search.html busque por glossaries, baixe o pacote glossaries.tds.zip, descompacte e mova os arquivos para /usr/share/texmf sudo mktexlsr Baixe as dependências: xfor.sty (http://tug.ctan.org/tex-archive/macros/latex/contrib/xfor/) mova os arquivos para usr/share/texmf/tex/latex/. sudo mktexlsr

O GBParsy é uma biblioteca para realizar o parser de arquivos GenBank para o Python. No Ubuntu para realizar a instalação do módulo eu segui as instruções http://code.google.com/p/gbfp/wiki/HowToInstall até o ponto em que a instrução "$ python setup.py build " produziu o erro de ausência do arquivo "python.h". Para resolvê-la, sudo apt-get install python-dev site do projeto: http://code.google.com/p/gbfp/ Artigo: http://www.biomedcentral.com/1471-2105/9/321

No meu ACER Aspire 5738, o Ubuntu, na configuração inicial, fazia com que o teclado numérico, os operadores aritméticos não funcionassem corretamente... revirei a parte de teclado e não achei o problema... e depois fui identificar que o problema estava com o mouse... vejam só: Na opção do menu: Sistema / Preferência / Teclado Abre-se uma caixa de dialogo e na aba "teclas do mouse" vem, por default, marcado a opção "Permitir controlar o ponteiro usando o teclado". Ao desmarcar essa opção o teclado numérico volta a ter a função para a qual foi desenvolvido. Para quem quiser modificar o comportamento das teclas para ficarem mais próximas do Windows ou do MAC, vá na aba "Disposições" e no botão "Opções de disposição". Irá encontrar diversas forma de personalizar o comportamento do teclado no Ubuntu.